中国科学技术大学团队在 Nature 发表 structRFM:一个学过 RNA 折叠方式、权重和数据全部公开的 RNA 模型

中国科学技术大学的研究团队(合作者来自浙江大学)11 月 4 日在 Nature 发表了 structRFM。RNA 能做什么,很大程度上取决于它怎么折叠,也就是链上哪些碱基彼此配对,但以往的 RNA 语言模型大多只从序列里学习。structRFM 在预训练时把碱基配对信息直接放进去,用了 2100 万对 RNA 序列和对应结构。论文报告,改成三维结构预测用的版本 Zfold 在 CASP15 天然 RNA、CASP16 和 RNA-Puzzles 三组测试里与 AlphaFold3 表现相当;模型也能用于 RNA 功能预测,并能推广到新公布的 RNA 家族和长链非编码 RNA。训练数据、模型权重和代码都已公开。

为什么重要

这是发表在 Nature 主刊的 AI 研究,三维结构预测与 AlphaFold3 相当,而且训练数据、权重和代码全部公开,做 RNA 研究的人可以直接拿来用。

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